Styret i Sandviksboder Kystkultursenter AS består av fem personer. Leder og nestleder er oppnevnt politisk av Bergen kommune. De øvrige er representanter fra Museum Vest, Norges Fiskerimuseum, Bergen kystlag, samt en som er valgt til å representere øvrige brukere av senteret.

Følgende sitter i styret:

Leder: Veslemøy Gullachsen (kommunal representant)

Nestleder: Ragnar Berg-Hansen (kommunal representant)

Medlem: Bjørn Djupevåg (Museum Vest, Norges Fiskerimuseum)

Medlem: Tom Backer Johnsen (Bergen kystlag)

Medlem: Tore Solberg (øvrige brukere)